20 квітня 2000 року перший заступник начальника Генштабу Росії Валерій Манілов заявив, що широкомасштабні бойові дії у Чечні закінчилися. 23 січня 2001 року президент Путін ухвалив рішення про часткове виведення російських військ з республіки.

Активна фаза бойових дій тривала з 1999 по 2009 рік, потім у міру встановлення контролю Збройними силами Росії над територією Чечні, перейшла у відання місцевих чеченських сил самоврядування та самооборони. З 0 години 16 квітня 2009 року режим КТО скасовано.

1992—1994 року внаслідок озброєних нападів загинуло 26 залізничників. Ситуація, що склалася, змусила уряд Росії прийняти рішення про припинення руху по території Чечні з жовтня 1994 року.

Війна спочатку проводилася під гаслом мінімальних втрат, і до штурму Грозного число втрат було відносно невеликим. Згідно з офіційними даними, з 1 жовтня 1999 року по 23 грудня 2002 року загальні втрати федеральних сил (всіх силових структур) Чечні склали 4572 особи вбитими та 15 549 пораненими.