І запропонували боярам замість царя Шуйського обрати на російський престол сина Сигізмунда III, королевича Владислава, який, за їхніми словами, охоче прийме православну віру.
У 1606 р. брав участь у змові проти самозванця. Після повалення Василя Шуйського очолив Семибоярщину, брав участь у обранні царем королевича Владислава, а після вигнання поляків – Михайла Романова.
Новим царем став син Бориса Годунова – Федір. Але у червні 1605 р. у Москві спалахнув заколот прихильників Лжедмитрія. Федора Годунова і його мати вбили, залишивши в живих тільки дочку Бориса – Ксенію.