Метронідазол успішно застосовується для лікування анаеробних інфекцій органів грудної клітки, голови, шлунково-кишкового тракту та сечостатевої системи, а також анаеробної септицемії та бактеріємії.
Метронідазол, як і інші 5-нітроімідазоли, активний щодо більшості грампозитивних і грамнегативних облігатних анаеробних бактерій, спороутворюючих і неспороутворюючих, а також щодо анаеробних коків.
Для лікування неспецифічного вагініту; бактеріального вагінозу; трихомонадного вагініту.