Проблема в тому, що це надзвичайно інтенсивний з точки зору обчислень. Типовий білок містить сотні амінокислот, тобто тисячі атомів. Але середовище також має значення: білок взаємодіє з навколишньою водою під час згортання. Отже, у вас є близько 30 тисяч атомів для моделювання. 30 листопада 2020 р

Ще одна причина, чому передбачити структуру білка так важко, полягає в тому, що поліпептид дуже гнучкий, зі здатністю обертатися кількома способами на кожній амінокислоті, що означає, що поліпептид може складатися в приголомшливу кількість різних форм.

Білок вважається неправильно згорнутим, якщо він не може досягти свого нормального природного стану. Це може бути через мутації в послідовності амінокислот або порушення нормального процесу згортання зовнішніми факторами.

Проблема згортання білка є питання про те, як послідовність амінокислот білка визначає його тривимірну атомну структуру. Поняття «проблеми» згортання вперше виникло приблизно в 1960 році, коли з’явилися перші білкові структури з атомарним розділенням.

Неправильне згортання білків – це звичайна клітинна подія, яка може відбуватися протягом усього життя клітини, викликана різними подіями, зокрема генетичні мутації, помилки трансляції, аномальні модифікації білків, термічний або окислювальний стрес і неповні комплексні утворення.

Проблема в тому, що це надзвичайно інтенсивний з точки зору обчислень. Типовий білок містить сотні амінокислот, тобто тисячі атомів. Але середовище також має значення: білок взаємодіє з навколишньою водою під час згортання. Отже, у вас є приблизно 30 тисяч атомів для моделювання.