При СРК не виявляються макроскопічні зміни, водночас за будь-якого істинного коліті слизова оболонка товстої кишки ерозована або виразка, в біоптатах виявляють крипт-абсцеси, лейкоцитарні інфільтрати, фібринозні накладення.

Вважається, що хронічний коліт діагностується у половини людей із проблемами органів травлення. Характерною ознакою є нестійкий стілець: чергування запорів та діареї. Крім цього можуть спостерігатися втрата апетиту, що веде до зменшення маси тіла, нудота, відрижка, відчуття гіркоти в роті.

Головний симптом СРК – біль у нижній частині живота, що супроводжується зміненою діяльністю кишечника. Симптоми синдрому роздратованого кишечника: Біль у нижній частині живота або почуття дискомфорту в животі, переважно спастичного та змінного характеру.