Для лактазної недостатності характерно розвиток кишкових симптомів після прийому молока та молочних продуктів: метеоризм, болі та бурчання в животі, діарея, здуття живота. Можлива нудота. Стілець рідкий або кашкоподібний, світло-жовтого кольору, із кислим запахом.
Симптоми лактазної недостатності зазвичай з'являються через якийсь час після народження. Це коліки, частий плач, підвищене газоутворення, випорожнення – то запор, то діарея (з часом він стає пінистим, у ньому можуть з'явитися зелень, слиз і навіть кров).
На відміну від простих немовлят колік, які частіше бувають у вечірній час, занепокоєння при лактазної недостатності трапляється у час доби. Живіт здутий, багато газів, бурчання по ходу кишечника, часті відрижки, стілець може бути частим (6-15 разів на день), водянистим, пінистим, легко вбирається в памперс.