У тонкій кишці виробляються ферменти, які разом із ферментами, вироблюваними підшлунковою залозою і жовчним міхуром, сприяють розщепленню їжі окремі компоненти.
З просвіту тонкої кишки відбувається всмоктування продуктів ферментативного розщеплення харчових інгредієнтів білків, жирів та вуглеводів у кровоносні та лімфатичні судини.
Найбільше поглинається органічних речовин в тонкому кишечнику. Амінокислоти та глюкоза потрапляють у кров. Жирні кислоти та гліцерин (продукти розпаду жирів) надходять у лімфу. Всі ці речовини розносяться по організму і потрапляють у різні тканини та органи.