Ім'я Малолос було імовірно походить від тагальського слова "Paluslos", що означає "вниз".

Малолос був місце конституційної конвенції 1898 року, відомої як Конвенція Малолос, яка призвела до створення Першої Філіппінської республіки, у святилищі церкви Барасоаїн. Монастир Малолосського собору в той час служив президентським палацом.

Ця церква особливо відома він використовувався як резиденція влади або офіс першого президента Філіппін Еміліо Агінальдо, з вересня 1898 р. по березень 1899 р.

Політична конституція 1899 року (ісп. Constitución Política de 1899), неофіційно відома як конституція Малолос, була конституція Першої Філіппінської Республіки.

Філіппінська республіка (ісп. República Filipina), яку зараз офіційно називають Першою Філіппінською республікою, а історики також називають Республікою Малолос, була заснована в Малолосі, Булакан під час Філіппінської революції проти Іспанської імперії (1896–1898) та Іспано-американська війна між…

Тубільці, не знаючи іспанської мови, відповіли, що течія річки в цій частині йде вниз за течією – "палуслос", що іспанці вимовляють як "Малолос". Зіпсованість слова роками призвела до нинішнього «Малолоса». Місто виникло з невеликого поселення, заснованого іспанськими місіонерами.