У червні 2009 року Sony Online Entertainment припинила обслуговування The Matrix Online через низькі номери передплати. Сервіс було офіційно закрито 1 серпня 2009 року. На той час у ньому було менше 500 активних гравців.

Гра була пізніше вилучено з біржі 9 липня 2022 року.

Через те, що поле не вразило менепоряд з тим фактом, що він не просто хотів зніматися в більш науково-фантастичних фільмах за участю інопланетян, як-от «День незалежності» та «Люди в чорному», він відмовився від Нео та «Матриці», щоб натомість знятися у фільмі «Дикий, дикий захід». Сміт зізнається, що не пишається останнім, особливо через його табірність.

Канонічний статус The Matrix Online завжди був неоднозначним, і після виходу «Воскресіння Матриці» було піднято велике питання про те, як його слід вважати канонічним (дещо можна порівняти з тим, як попередні комікси «Матриця» відрізнялися продовженням до остаточного всесвіту фільмів).

Бета-версії Matrix або версії Prototype Matrix — це попередні версії Matrix, створені The Architect перед поточною відомою версією. Таких бета-версій було дві і обидві версії значно зазнали невдачі, оскільки більшість людства не змогла прийняти програмування та вмирає в результаті.

продала права на гру компанії Sony Online Entertainment, і 15 серпня 2005 року останньому було передано розробку та експлуатацію гри. Sony Online Entertainment припинила роботу гри 31 липня 2009 року.