Група складалася з трьох команд: Team J, Team KIII і Team T. Крім того, у групі також є стажери під назвою JKT48 Academy. У березні 2021 року група розпустила всі команди та академію, з усіма членами лише під JKT48.

JKT48 мав загальну кількість 227 оригінальних учасників протягом 12 поколінь, а також 3 члени Team Kaigai та 1 тимчасовий студент по обміну. Станом на серпень 2024 року JKT48 налічує 26 членів і 26 стажерів. Наразі чотири покоління (1-е, 2-е, 4-е та 5-е) не мають активних учасників.

5 днів тому 30 серпня 2023 року Хонда оголосила, що закінчить навчання в AKB48. Її останнім синглом із групою був «Idol Nanka Janakattara», 62-й сингл AKB48, який вийшов 27 вересня.

У відповідь було оголошено про суттєві зміни в структурі управління AKB48, коли окремі компанії самостійно керуватимуть кожною з японських груп. У 2011 році Перша сестринська група AKB48 за межами Японії, JKT48, було оголошено; група базується в Джакарті, Індонезія.

Після того, як з'явилися фотографії з їхніми хлопцями, Нацумі Хіраджіма та Румі Йонезава вийшли з групи і були замінені Джуріною Мацуї з SKE48 і Міюкі Ватанабе з NMB48. 24 березня AKB48 оголосив, що п’ять стажерів будуть підвищені до команди 4, розширивши її список до 16.